分子互作研究科普:有了亲和力,为什么还要结合动力学数据?

2022-11-27 点击数:0 分享至:

通常我们用亲和力来描述两种分子间相互作用的强弱。对于极强的相互作用,亲和力可以达到pM级。对于弱的相互作用,亲和力仅有mM级。大多数分子间相互作用的亲和力都会在此范围内。从数学角度来说,亲和力是指占据一半的结合位点时分析物的浓度,如下图所示:

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亲和力仅仅是冰山一角

 测定亲和力的方法有许多,例如我们耳熟能详的ELISApull-down实验等。虽然亲和力非常重要,但这仅仅是分子间相互作用分析的冰山一角。除了亲和力之外,还有两个对分子间相互作用评估至关重要的指标(Ka,Kd):用来解析分子间结合反应快慢的动力学以及分子间的结合特异性。这些指标对我们了解生物系统,特别是理解疾病发生的分子机制及相应的药物开发至关重要。

 

结合动力学的重要性

      

      下图是使用表面等离子共振技术所测定的四条实时结合曲线,这四条曲线所得到的亲和力是一致的,所以这四种结合理论上应该也是一致的。但是通过比较结合速率常数(Kon)和解离速率常数(Koff),即结合动力学数据后我们可以发现这四种结合有着截然不同的性质。

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 图中黑线所示组分结合速率非常高,这意味着形成反应只需很少的能量。但同时解离速率也非常大,说明这两种分子间的结合力并不强。其他三条线的结合速率依次降低,表明其发生结合越来越难,但是一旦发生结合,他们之间的相互作用便越来越强。如果没有这些结合动力学数据,我们便无从得知这些分子间相互作用的性质差异。因此,表面等离子共振技术(SPR)无论是对文献发表还是医学研究都是必不可少的。

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         过去的二十多年间,使用SPR技术发表的科学文献显著增长。

 

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