胆固醇是动物细胞膜中的重要脂质成分,与多种蛋白质存在相互作用。然而,由于胆固醇在水中的溶解度低,传统研究方法存在局限性。2022年发表“Cholesterol Chip for the Study of Cholesterol–Protein Interactions Using SPR”利用SPR技术研究胆固醇与蛋白质的相互作用,揭示其动力学特性。
本研究合成生物素化胆固醇,将其固定在链霉亲和素(SA)芯片上,通过SPR技术测量不同浓度的Hedgehog(Hh)和PTP1B蛋白与胆固醇的结合动力学,得到结合速率常数(ka)、解离速率常数(kd)和解离常数(KD)。
结合速率常数(ka):通过比较不同蛋白质浓度下的结合速率(即RU增加的速度),可以拟合出结合速率常数。ka值越大,表示结合速率越快。
解离速率常数(kd):解离相反映了蛋白质从胆固醇表面解离的速度。通过拟合解离过程,可以得到解离速率常数kd。kd值越大,表示解离速率越快。
解离常数(KD):KD是评价蛋白质与胆固醇结合亲和力的关键参数,它等于解离速率常数与结合速率常数的比值(KD = kd / ka)。KD值越小,表示结合亲和力越强。
SPR实验的关键步骤
样品准备:合成生物素化胆固醇。同时,准备待测的胆固醇结合蛋白样品。
实验设置:将SA芯片安装到SPR仪器上,设置实验参数,如流速、注射时间等。并将生物素化胆固醇固定在链霉亲和素(SA)芯片上。
数据收集:将不同浓度的胆固醇结合蛋白样品依次注射到芯片表面,通过SPR仪器实时监测蛋白质与胆固醇的结合过程。
SPR实验结果分析
Hh与胆固醇的相互作用:结合速率常数ka为1.81×105 (±500)(1/Ms),解离速率常数kd为2.60×10-3(±1.20×10-4)(1/s),解离常数KD约为14 nM。
PTP1B与胆固醇的相互作用:结合速率常数ka为1.33×104 (±220)(1/Ms),解离速率常数kd为1.9×10-3 (±7.4×10-6)(1/s),解离常数KD约为85 nM。
SPR实验的优势
实时监测:SPR技术可以实时监测生物分子间的相互作用过程,无需对样品进行标记或处理。
高灵敏度:SPR仪器对折射率的变化非常敏感,可以检测到纳摩尔级别的生物分子相互作用。
样品需求量少:与核磁共振(NMR)或X射线晶体学等方法相比,SPR技术具有样品需求量少、实时测量动力学参数等优势。
研究结论:成功合成了生物素化胆固醇并将其固定在SA芯片上,通过SPR技术研究了胆固醇与Hh和PTP1B的相互作用动力学。
该方法为研究胆固醇与其他蛋白质的相互作用提供了新的途径,有望促进对胆固醇生物学功能的深入理解。
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