位置：分子互作仪 / LSPR分子互作系统
香菇多糖及其天然受体dectin-1相互作用的分子动力学模拟
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香菇多糖是一种β-1,3-D葡聚糖，是临床上用于肿瘤治疗的免疫增强药物。其天然受体Dectin-1是一种细胞表面免疫受体，在真菌病原体的免疫防御和β-葡聚糖介导的免疫调节中起着重要作用。但是香菇多糖的抗肿瘤免疫机理目前尚未清楚。
2021年1月8日同济药学院吴秀聪团队在Biological Macromolecules上在线发表了研究“Molecular dynamics simulation of lentinan and its interaction with the innate receptor dectin- 1”
在这项研究中作者通过Nicoya OpenSPR分子互作仪测定了香菇多糖对dectin-1的亲和力，结合曲线如图1所示,结果显示香菇多糖与dectin-1的结合常数Kd为5.08×10−6M。证实Dectin-1可能是香菇多糖被识别并发挥药理活性的关键蛋白。
图2 香菇多糖与Dectin-1 的ZDOCK刚性对接结果
图3 香菇多糖重复单元与Dectin-1 的DOCK分子对接结果
为了进一步研究香菇多糖与dectin-1的相互作用，作者对香菇多糖及能量最小化优化后的香菇多糖重复单元分别与dectin-1进行分子对接。刚性对接结果证实香菇多糖作为一种大分子，可以与蛋白dectin-1表面结合，如图2所示。优化后的重复单元有很多可旋转的键，灵活性很大，很难绑定到Trp221和His223之间形成的凹槽中，而对于具有三重螺旋结构的大分子香菇多糖来说，侧链外露，更容易插入沟槽中,如图3所示。这也是为什么dectin-1能够识别香菇多糖的原因。
