虚拟筛选服务
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虚拟筛选服务
随着科技的发展，当前已经拥有庞大的生物分子数据库以及各种各样的药物分子数据库，而传统的实验手段已经难以从庞大的数据库中快速的筛选出符合特定需求的分子体系。目前我们已经可以通过分析确定药物的作用机制，并在此基础上通过计算机模拟筛选的方式快速的筛选出符合特定条件的一系列分子，从而大大的加快分子筛选过程。
据统计数据显示，成功研制一种新药需要约10—12年的时间，耗资10亿—15亿美元。计算机辅助药物设计技术能通过干涉新药发现流程，大量降低研发成本和时间，增加社会经济效益， 国内外利用CADD辅助药物设计工具取得了非常了不起的成绩。
实体的药物筛选方法有严重的缺点：成本高、效率低、速度慢、样品量大、阳性率低（< 0.1‰）。相比之下，虚拟筛选（virtual screening, VS）方法具有很大的优势。采用高通量虚拟筛选方法可从大型化合物库（如约20万个化合物的SPECS库，超过1亿个可购买化合物的ZINC库）中迅速筛选出有潜在活性的药物分子，阳性率一般在5%~20%。
我们理解大多数研究者对虚拟筛选准确率低、假阳性率高的诟病，这些问题通常来自于傻瓜式的操作和对研究体系缺乏充分了解。
尽管针对药物设计的软件和策略层出不穷，但被运用来寻找到有效的苗头化合物，进而发展成先导化合物，是极其艰难的一件事情。
在整个药物发现的过程中，布满了各种陷阱，不少是非常隐秘的。
对一个全新的体系采用单一方法进行虚拟筛选，其准确率往往远低于文献报道的研究结果。
研锦生物深谙每种方法都有其固有的缺陷，因此，在充分了解研究体系的情况下，我们通常采用多模型方案与平行和（或）串行的筛选策略，并根据先验的成功概率和后验的命中率仔细挑选策略和设计方案，借助统计学这一强有力的工具，提高我们对筛选策略的成败把握。
值得注意的是，我们的专家知识在提高命中率上给了很大帮助，这归功于研锦生物多年积累的丰富经验。
研锦生物在药物的虚拟筛选方面进行过大量研究，有着丰富的实践经验和核心技术。根据具体的研究项目，我们将为客户提供有针对性的高性价比的筛选方案。同时，还可提供小分子化合物库等服务。
高通量高精度分子对接（Docking）
基于形状匹配的分子相似度计算（Shape-based Similarity）
基于配体或受体的药效团构建与筛选（Pharmacophore）
反向寻靶（Target Fishing）
虚拟筛选库类别 | 说 明 |
ZINC全部可购买库 | 化合物数量19582419个 来源于ZINC数据库，能购买到，适用于大规模的虚拟筛选。 |
ZINC先导化合物库 | 化合物数量6184622个 来源于ZINC数据库，能购买到，分子量在250~350，logP<=3.5，可旋转键数目<=7。 |
ZINC类药化合物库 | 化合物数量15009925个 来源于ZINC数据库，能购买到，分子量在150~500，logP<=5，可旋转键数目<=7，tPSA<150, HBD<=5,HBA<=10。 |
ZINC片段库 | 化合物数量667834个 来源于ZINC数据库，能购买到，分子量<250，logP<=3.5，可旋转键数目<=5。 |
ZINC天然产物库 | 化合物数量25万个 来源于ZINC数据库，其中大部分在售，有些不能购买。 |
中草药成分库（VIP免费筛选） | 化合物数量33765个 中草药成分库涵盖了8445种中草药，包括发散风寒药、发散风热药、清热泻火药、清热燥湿药、清热解毒药、清热凉血药、清虚热药、攻下药、润下药、峻下逐水药、利水消肿药、利水通淋药、利水退黄药、理气药、止血药等。 |
供应商Chembridge | 化合物数量653850个 来源于Chembridge，包含类药化合物和先导化合物。 |
供应商Chemdiv | 化合物数量1261245个 来源于Chemdiv，总量大，具有超过14,000种母核，多样性丰富，新化合物多。 |
供应商Enamine | 化合物数量1393713个 来源于Enamine，数量大，多样性丰富。 |
供应商InterBioScreen | 化合物数量441574个 来源于InterBioScreen，多样性丰富。 |
供应商Lifechemicals | 化合物数量368367个 来源于Lifechemicals，多样性丰富。 |
供应商Maybridge | 化合物数量61756个 来源于Maybridge，多样性丰富。 |
供应商Specs | 化合物数量200187个 来源于Specs，多样性丰富。 |
库存-农药库 | 化合物数量172254个 涵盖了除草剂、杀虫剂、杀菌剂等农药化合物分子，有库存，购买方便。 |
库存-片段库 | 化合物数量102309个 分子量<300，有库存，购买方便。 |
库存-上市药物库 | 化合物数量2798个 包含被批准（FDA、EMEA或其他机构批准）的药物分子，具有化学多样性、已知的生物药效率以及安全性，降低药物筛选风险，有库存，购买方便。 |
库存-特殊品种化合物 | 化合物数量1215个含特殊品种的化合物 包括核受体的配体小分子化合物、离子通道配体小分子化合物、肾上腺素受体的配体小分子化合物等化合物种类，有库存，购买方便。 |
天然产物库 （VIP免费筛选） | 化合物数量7507个 库中包含的天然产物来源于植物、动物以及微生物，分子结构多样性丰富，几乎涵盖大部分已知的天然产物结构类型，有库存，购买方便。 |
库存-已知活性库 | 化合物数量35417个 包含了已知活性或靶点明确的小分子化合物，包括一些上市药物化合物，适用于老药新用、药物靶点机制研究和阳性化合物对照等，有库存，购买方便。 |
宝鸡市辰光生物科技有限公司化合物库 | 化合物数量637个 来源于植物天然产物，包含皂甙类、黄酮类、生物碱类等。 |
FDA批准的药物 （VIP免费筛选） | 化合物数量2388个FDA批准的药物的结构。 |
实验中的药物 （VIP免费筛选） | 化合物数量5166个实验中的药物。 |
小分子肽库 | 小分子肽库中的结构为计算得到的小分子结构，由20种氨基酸任意组合形成的二肽、三肽、四肽结构，数目分别为400个、8000个、16万个。 |
研锦生物可以利用基于靶点或小分子结构的药物设计方法，对可购买化合物、天然产物等数据库进行虚拟筛选，并获得潜在活性的化合物列表供进一步活性实验确证。
面向制药企业和科研院所，可提供一站式的早期药物研发服务，包括虚拟药物筛选、先导优化、靶标预测、 动力学模拟等，涉及小分子化学药、生物药、中药等多种新药类型，为您提供优质的药物发现服务。
